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El receptor NMDA, junto con el receptor AMPA, es un receptor clave de glutamato, a menudo encontrado juntos en sinapsis, como en la región CA1 del hipocampo. Cuando una neurona presináptica es débilmente estimulada, libera glutamato, que se une a ambos receptores. Sin embargo, bajo estimulación débil, solo los receptores AMPA son típicamente activados, lo que lleva a una ligera despolarización de la neurona postsináptica. Los receptores NMDA, cuando se activan a voltajes ligeramente despolarizados, permiten un flujo mínimo de iones debido a un bloqueo de iones de magnesio en el poro del canal, impidiendo el movimiento libre de iones. Esta distinción en la activación de receptores juega un papel crucial en la señalización sináptica.