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El texto discute el análisis de secuencias de ARN y menciona dos vías dependiendo de la presencia de una referencia. Si hay una referencia, las lecturas se limpian y se mapean de nuevo para contar. Sin una referencia, las lecturas se ensamblan encontrando secuencias superpuestas para crear una transcripción. El objetivo es construir una secuencia continua de lecturas superpuestas para producir una transcripción en genómica comparativa.
